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Regula la financiación por el Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades de hasta doce ayudas de doctorado por curso en el Instituto Universitario Europeo (IUE), para investigadores con nacionalidad o residencia legal en España. Las ayudas duran tres años y el IUE gestiona su pago mensual.

Modifica el Real Decreto 53/2013 sobre protección de animales usados en experimentación y docencia. Actualiza los anexos II y III sobre alojamiento, cuidado y métodos de eutanasia, e introduce cambios administrativos y de organización, como un programa nacional de control oficial y un punto de contacto con la Comisión Europea.

Regula la concesión directa de subvenciones a universidades españolas que forman parte de Alianzas Europeas de Universidades seleccionadas por la Comisión Europea. Establece el procedimiento, las entidades beneficiarias, las obligaciones, el plazo de ejecución, la cuantía y la justificación de las ayudas.

Amplía en 16.975.383,48 euros el presupuesto de la convocatoria de ayudas del proyecto europeo de salud Med4Cure, convocada por la Orden CNU/1418/2024. El dinero procede del remanente de otra convocatoria de proyectos de I+D Multi-país del CDTI.

Establece las bases para conceder ayudas públicas a empresas y entidades que participan en el proyecto europeo de salud Med4Cure, y abre la convocatoria de esas ayudas. Las ayudas financian investigación, innovación y primera producción industrial de productos sanitarios y procesos farmacéuticos innovadores.

Modifica las bases reguladoras de las ayudas públicas del Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2021-2023 gestionadas por la Agencia Estatal de Investigación. Adapta esas bases a la reforma de la Ley de la Ciencia en igualdad de género, interrupciones o prórrogas de contratos de recursos humanos y seguimiento económico, y al nuevo Marco europeo de ayudas estatales de I+D+i.

Establece la estructura orgánica básica de los 22 departamentos ministeriales, fijando los órganos superiores y directivos de cada uno. Desarrolla la reestructuración ministerial previa y regula la subsistencia de órganos, adscripciones y régimen transitorio.

Reorganiza la Administración General del Estado en 22 ministerios y fija las competencias y la estructura interna de cada uno. También adscribe organismos públicos a los nuevos departamentos y suprime los órganos que desaparecen.