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Regula cómo se organizan y ejecutan los controles oficiales sobre la cadena agroalimentaria en España, para aplicar la normativa europea sobre alimentos, piensos, sanidad animal y vegetal. Incluye la toma de muestras, los análisis de laboratorio y las actuaciones ante riesgos o incumplimientos.

Modifica la normativa sobre el Sistema de información de explotaciones agrícolas y ganaderas (SIEX), el Registro autonómico de explotaciones agrícolas (REA) y el Cuaderno digital de explotación agrícola (CUE). Establece que el uso del cuaderno digital sea voluntario, salvo que otra norma exija tener cuaderno de explotación.

Modifica dos reglamentos técnicos sobre control y certificación de plantas de vivero de frutales y de materiales de reproducción de plantas ornamentales. Con ello incorpora al ordenamiento español una directiva europea que actualiza la lista de plagas reguladas de estos vegetales.

Establece dos programas nacionales para los cítricos: uno para controlar y erradicar el insecto Trioza erytreae y otro para prevenir la llegada de Diaphorina citri y de la bacteria Candidatus Liberibacter spp., que causa la enfermedad del «greening». Regula prospecciones, medidas ante su detección, zonas demarcadas e indemnizaciones.

Modifica el Real Decreto 1311/2012, que regula el uso sostenible de los productos fitosanitarios. Añade reglas para calcular indicadores de uso de estos productos en cada explotación agrícola y valores de referencia nacionales, y regula controles y actuaciones.

Crea y regula el Sistema de información de explotaciones agrícolas y ganaderas y de la producción agraria (SIEX), el Registro autonómico de explotaciones agrícolas (REA) y el Cuaderno digital de explotación agrícola (CUE). Reúne en un solo sistema informático datos agrarios que ahora están dispersos y pone a disposición de los productores herramientas digitales gratuitas.

Crea y regula el Registro de Operadores Profesionales de Vegetales (ROPVEG) y fija las condiciones para que los operadores autorizados puedan expedir pasaportes fitosanitarios. También establece obligaciones para los productores de material vegetal de reproducción y modifica varias normas sobre agricultura.

Adapta la normativa española al nuevo marco fitosanitario de la Unión Europea, que se aplica directamente desde diciembre de 2019. Deroga normas nacionales obsoletas y reúne en un solo texto las disposiciones sobre plagas de los vegetales, controles oficiales, programas de erradicación y el Comité Fitosanitario Nacional.

Regula cómo se certifica oficialmente que los vegetales y productos vegetales españoles cumplen los requisitos fitosanitarios del país de destino antes de exportarlos. Establece obligaciones para exportadores, entidades auditoras, agentes de control y laboratorios, y el procedimiento para expedir los certificados.

Establece reglas específicas para tramitar los procedimientos sancionadores en materia de sanidad vegetal y de sanidad y protección animal cuando la competencia es de la Administración General del Estado, en el ámbito de importaciones y exportaciones. Fija el plazo de tramitación y una reducción de la sanción pecuniaria.

Modifica varios reales decretos sobre control y certificación de plantas de vivero y materiales de reproducción vegetal. Adapta la normativa española a las reglas europeas sobre plagas de los vegetales en semillas y plantones. También permite delegar en otras personas jurídicas y fija requisitos para pruebas científicas.

Aprueba el Reglamento sobre el acceso a los recursos fitogenéticos para la agricultura y la alimentación, y a los cultivados para otros fines. Desarrolla el título IV de la Ley 30/2006 y regula el acceso, las medidas de control, una comisión nacional y el fomento de los derechos de los agricultores.

Modifica el Real Decreto 23/2016, que regula el programa nacional de control y erradicación de la plaga Trioza erytreae y el programa de prevención de Diaphorina citri y Candidatus Liberibacter spp. Adapta la norma al nuevo régimen fitosanitario de la Unión Europea y excluye de la erradicación a Canarias.