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Establece la organización interna del Ministerio de Sanidad, desde sus órganos superiores hasta las subdirecciones generales, y reparte sus funciones en materia de salud, planificación sanitaria, salud pública, farmacia y ordenación profesional. También modifica la estructura orgánica básica de los departamentos ministeriales.

Desarrolla la estructura orgánica básica del Ministerio de Ciencia e Innovación. Fija sus órganos directivos hasta el nivel de subdirección general y define las competencias de cada uno. También adscribe al ministerio varios órganos colegiados de ciencia e innovación.

Crea doce Subsecretarías en los ministerios de nueva creación y suprime siete Subsecretarías de ministerios anteriores. También fija cómo se mantienen las delegaciones de competencias, el personal y los servicios comunes hasta que se complete la nueva organización.

Reorganiza la Administración General del Estado y fija los 22 ministerios que la componen, con sus competencias y sus órganos superiores, como secretarías de Estado.