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Desarrolla el Registro general de fabricantes y otros agentes económicos de productos fertilizantes (REGFER), creado por el Real Decreto 1051/2022. Fija su estructura, las secciones, el número de registro, la inscripción y las obligaciones de información de los operadores que ponen fertilizantes a disposición de los agricultores.

Establece las bases reguladoras de las ayudas para pescadores enrolados en buques pesqueros españoles cuya actividad se paraliza temporalmente durante el periodo 2021-2027. Las ayudas se financian con el Fondo Europeo Marítimo, de Pesca y Acuicultura (FEMPA) y se gestionan por el Instituto Social de la Marina y por la Subdirección General de Acuicultura, Comercialización Pesquera y Acciones Estructurales.

Modifica las normas de nutrición sostenible de los suelos agrarios. Ajusta obligaciones sobre el cuaderno de explotación y el plan de abonado, y facilita el uso de estiércoles y abonos orgánicos. También fija cuándo empiezan a aplicarse estas obligaciones.

Regula la concesión directa de subvenciones en materia agroalimentaria y pesquera. Fija las entidades beneficiarias, las actuaciones que se financian, las cuantías, el pago y la justificación, así como los incumplimientos y reintegros.

Regula la concesión directa de ayudas para compensar los daños en la actividad agraria causados por los grandes incendios forestales de 2025. Incluye una ayuda por pérdida de renta en explotaciones afectadas y otra para incrementar la subvención a la prima del seguro agrario combinado.

Establece las bases para dar ayudas a los armadores y propietarios de buques de pesca de entre 12 y 15 metros de eslora para comprar e instalar equipos de localización vía satélite. También convoca estas ayudas para el año 2025, financiadas por el Fondo Europeo Marítimo, de Pesca y de Acuicultura.

Modifica la composición de la Mesa Nacional del Regadío para incluir a una persona de la Asociación Española de Desalación y Reutilización y a un representante de cada organización profesional agraria más representativa en el ámbito estatal.

Crea y regula la Junta de Contratación y la Mesa única de Contratación del Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación. La Mesa única asiste de forma permanente a los órganos de contratación unipersonales del Ministerio. Se adapta la organización a la estructura fijada por el Real Decreto 717/2024.

Establece las bases para dar subvenciones directas a las organizaciones profesionales agrarias declaradas más representativas en el ámbito estatal. Estas ayudas financian sus actividades de representación y colaboración ante la Administración General del Estado y ante la Unión Europea u otras instituciones.

Actualiza la composición y el funcionamiento del Comité de Participación del Consejo Interministerial de Organismos Modificados Genéticamente. Adapta este órgano a la nueva estructura de la Administración General del Estado y a la Ley 40/2015. Regula quién lo forma, cómo se nombra a sus miembros y sus funciones.

Establece las bases para conceder subvenciones, en concurrencia competitiva, a entidades asociativas del sector agrario y alimentario. Financia sus actividades de colaboración y representación ante la Administración General del Estado y la Unión Europea, y otras actividades de especial interés para el sector agroalimentario español.

Establece las bases para dar ayudas a los buques de arrastre de fondo del Mediterráneo que compren copos nuevos (la parte final de la red) con mallas de 45 mm para pesca de costera y 50 mm para pesca de profundidad. También convoca estas ayudas para 2025.

Modifica el Real Decreto 262/2019, que regula las Consejerías del Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación en el exterior. Añade una función a las consejerías y agregadurías, permite una prórroga excepcional de estancia, adapta la Comisión Técnica de Valoración y cambia la distribución de agregadurías en Brasil y Asia.

Modifica la estructura orgánica de varios ministerios. Permite que la persona titular de la Dirección General de Gestión Migratoria no sea funcionaria pública. También ajusta la estructura del Ministerio de Defensa y del de Agricultura, Pesca y Alimentación.

Modifica dos reales decretos sobre subproductos animales no destinados al consumo humano (SANDACH). Ajusta el reparto de competencias entre autoridades, los mecanismos de coordinación y el registro nacional de movimientos de estos materiales.

Modifica las bases reguladoras de las subvenciones para programas plurirregionales de formación dirigidos a profesionales del medio rural. Los cambios afectan sobre todo a la aplicación de las ayudas de minimis y a la justificación del gasto por módulos.

Modifica la normativa sobre el Sistema de información de explotaciones agrícolas y ganaderas (SIEX), el Registro autonómico de explotaciones agrícolas (REA) y el Cuaderno digital de explotación agrícola (CUE). Establece que el uso del cuaderno digital sea voluntario, salvo que otra norma exija tener cuaderno de explotación.