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Establece cómo se aplican en España los controles oficiales de la Unión Europea sobre bienestar animal en animales de granja. Crea un plan de bienestar animal, un Centro Nacional de Referencia y una mesa de coordinación, y modifica varios reales decretos sobre protección de terneros, gallinas, cerdos, pollos y transporte de animales.

Crea el Registro General de las Mejores Técnicas Disponibles en Explotaciones ganaderas y el sistema informático ECOGAN para calcular, seguir y notificar las emisiones de la ganadería. También fija obligaciones para los titulares de explotaciones y modifica varias normas agrarias.

Establece las reglas para aplicar en España el Reglamento europeo sobre fabricación, comercialización y uso de piensos medicamentosos. Fija condiciones de autorización de establecimientos, controles de homogeneidad y límites de contaminación cruzada, y modifica otras normas sobre ganadería.

Establece las normas básicas para ordenar las granjas porcinas intensivas: condiciones de bioseguridad, higiene, bienestar y sanidad animal, ubicación, gestión de estiércoles y reducción de emisiones. También regula la identificación de animales, el registro de explotaciones y los controles y sanciones, y modifica la normativa de las explotaciones de ganado porcino extensivo.