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Crea y regula el Registro de Operadores Profesionales de Vegetales (ROPVEG) y fija las condiciones para que los operadores autorizados puedan expedir pasaportes fitosanitarios. También establece obligaciones para los productores de material vegetal de reproducción y modifica varias normas sobre agricultura.

Regula cómo se certifica oficialmente que los vegetales y productos vegetales españoles cumplen los requisitos fitosanitarios del país de destino antes de exportarlos. Establece obligaciones para exportadores, entidades auditoras, agentes de control y laboratorios, y el procedimiento para expedir los certificados.

Esta orden fija los requisitos sanitarios para importar a España animales de especies que no tienen normativa sanitaria común en la Unión Europea. Regula cómo se determinan esos requisitos, el destino de los animales y los certificados sanitarios que ya existen.