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Regula el sistema de trazabilidad, identificación y registro de animales terrestres en cautividad, como bovinos, ovinos, porcinos, equinos, aves de corral y abejas. Establece los medios y plazos de identificación, los documentos de identificación y movimiento, el libro de registro de explotación y las bases de datos informatizadas.

Aprueba los modelos 504, 505 y 507 para solicitar autorizaciones de expedición o recepción de productos con impuestos especiales de fabricación (alcohol, tabaco, energía) con destino a la Unión Europea o procedentes de ella, y regula cómo presentarlos por vía electrónica. También regula la inscripción en el registro territorial de los operadores.

Establece las normas básicas para ordenar las granjas avícolas, tanto de carne como de puesta. Fija requisitos de higiene, bioseguridad, bienestar animal, ubicación, gestión de estiércoles y reducción de emisiones. Regula también el registro, la autorización y el movimiento de animales y huevos.